Fundado el 11 de septiembre de 1996.
Este museo cuenta con una numerosa colección de indumentaria de la fuerza, galería de cuadros, réplica a escala de las embarcaciones, material bibliográfico histórico, etc. Cedido en su mayoría por el Museo Central de la Prefectura Naval.
Es importante destacar que el primer gobernador del entonces Territorio de Santa Cruz, fue el Capitán de Marina Carlos María Moyano, quien se desempeñara como primer Subprefecto del Puerto de Santa Cruz. Estos hombres y mujeres constituyeron los albores de la actual ciudad de Río Gallegos, y lograron lo que hasta ese entonces era imposible: la integración territorial y la unidad nacional.
El 19 de Diciembre de 1885, se crea la subdelegación Marítima de Rio Gallegos, con apenas dos embarcaciones para la navegación costera y dos falúas para el servicio del puerto, constituyéndose en la primera autoridad y población por ese entonces sobre estas tierras. Ante este tan importante hecho se toma como fecha de fundación de la ciudad.
La instalación de una Subprefectura en Río Gallegos, respondió al propósito de prestar ayuda a todos los buques que navegaran por los mares del sur, cualquiera fuese su bandera, así como hacer efectiva la ejecución de las leyes y reglamentos que se dictaren relativos a la explotación de los productos naturales de la zona.
Museo de la Prefectura Naval Argentina
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